探索过程最常见的就是试错,试错,自然也是从成本最低的开始,没有什么比这个更简单,想到这里,陈翔立刻将使用鼠标,选择全部文档,右键选择比对所有。进度条顿时展开,比对结果实时展示。
一份200b的dna图谱,足够存储16亿个碱基对信息。十份dna测序图谱同时比对,这个运算量一般的电脑根本撑不住。不过,得益于软件需求是一群专业生物研究工作者提出,所以算法早就考虑到了生物科学的特殊性。比对按照增量的方式进行,即时开始,即时出具实时结果,又可以随时终止。
而且,更别提,实验室大楼内部早就配置一部超算,复杂计算可以委托超算进行处理。以超算每秒10的17次方每秒的运算速度,区区两百亿数据量的比对工作,根本不值得一提。
进度条几乎是眨眼即过,比对的结果应声而出。
程翔紧紧盯住屏幕,屏幕上,一份dna碱基对比对视图已经绘制完成,十份视图全部重合的部分则打印白色,存在不同则会黄色标注,点击上去,还能看到各编号视图在该位置时基因的实际情况。
不过因为显示和内存的关系,显示器同一时间只能显示一个区间段的结果。
这个区间分段足足十几万个。
程翔直接翻看旁边的统计结果。
这一看,程翔立刻放下了嘴边的枸杞茶,神情变得格外凝重。
粗检验,重合率百分之四十五。
去除丢失片段,重合率百分之六十,
再去掉本身遗失的片段,重合率足足百分之九十九点九九九!
“重合率百分之九十九点九九九!”
程翔深深吸了口气,拿起旁边的内线电话,就拨通了候志洁的办公座机,电话响了两声就被接起。
“侯主任,你来一下,我想,我已经有了发现。”